O Programa Brasil Empreendedor foi criado pelo governo federal, com o objetivo inicial de estimular o desenvolvimento das MPE. Os recursos do programa são provenientes do BNDES, que disponibilizou tais recursos para as instituições financeiras do governo federal responsáveis pela concessão de crédito.

Os agentes financeiros federais responsáveis pela operação do Programa Brasil Empreendedor foram: Banco do Brasil, Banco do Nordeste, Banco da Amazônia e Caixa Econômica Federal. A participação do Sebrae e de suas agências espalhadas pelo país, também foi de suma importância, pois sua responsabilidade foi a de desenvolver ações voltadas à capacitação empresarial dos empreendedores em busca de recursos financeiros.