Vamos à simulação de um modelo de uma população de coelhos. O processo de modelagem inicia-se com a diagramação do modelo, implementação das equações e valores iniciais. Em seguida, o modelo é simulado e o conjunto de dados gerados (dataset) é automaticamente armazenado. Finalmente, os dados da simulação podem ser analisados com as ferramentas de análise para identificar a dinâmica de comportamento das variáveis.

A construção de um modelo segue padrões de criação, análise e reconstrução, em um processo interativo até que o modelo atinja um nível adequado. Tanto o processo de simulação como o de análise de comportamento do modelo fazem parte do processo de refinamento.