Existem dois padrões de nomenclatura utilizados nos sistemas de arquivo FAT, os nomes curtos e os nomes longos. Os nomes curtos de arquivos e diretórios são limitados a oito caracteres, não contando os três caracteres associados a extensão dos arquivos e o caractere “.”, que é utilizado como separador. Além disso, o tamanho total do endereço absoluto dos arquivos é limitado a oitenta caracteres.

Além dos tradicionais caracteres alfanuméricos tradicionais (letras de A a Z e números de 0 a 9), no FAT os nomes curtos admitem a utilização dos seguintes símbolos especiais na nomenclatura dos arquivos:

A utilização dos nomes curtos esteve associada ao lançamento do Sistema Operacional MS DOS, que rodava sobre FAT16. Entretanto, com o desenvolvimento do SO Windows surgiu a necessidade de utilização de nomes de tamanho maior do que os oito caracteres utilizados no DOS.

O novo padrão utilizado, definido como nomes longos, permitia a utilização de 255 (duzentos e cinquenta e cinco) caracteres para definição do nome do arquivo e de 260 (duzentos e sessenta) caracteres para definição do endereço absoluto.

Apesar de manter a compatibilidade com os caracteres utilizados para criação dos nomes curtos, seis novos caracteres foram adicionados ao padrão de nomes longos: + [ ] , ; =.