Desabilitar pacotes é uma tarefa complexa e cansativa por isso, recomenda-se que se parta do inverso, ou seja, realizar uma instalação mínima e ir adicionando pacotes à medida que forem sendo necessários. Ao final da implantação do servidor, devem ser removidos pacotes temporários que porventura tenham sido instalados para a configuração do servidor. Paciência, conhecimento e persistência são princípios fundamentais para essa tarefa.

No Debian, o comando tasksel pode ajudar, pois através dele é possível selecionar as funcionalidades de que o servidor disporá, de modo que automaticamente os pacotes correspondentes são adicionados ou removidos.

Os pacotes podem ser desinstalados através de dois comandos: